| 統一編號 | 名稱 | 登記現況 | 營業狀況 | 地址 |
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| 21869006 | 仁心藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮炎峰里12鄰中正路618號 |
| 94921578 | 新鵬藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮炎峰里1鄰炎峰街8之12號 |
| 14612591 | 大愛藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮炎峰里炎峰街3號 |
| 61945917 | 萬安葯房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮炎峰里建國街16號 |
| 61136606 | 宏興西藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮明正里芬草路一段19號 |
| 61165806 | 東洋藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮明正里中正路793號 |
| 81502806 | 俊安藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮明正里中山街412號 |
| 45527198 | 新庄藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮新庄里2鄰芬草路43之6號 |
| 61790147 | 宏恩西葯房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮新庄里芬草路二段440號 |
| 61758603 | 今日藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮新庄里芬草路二段408巷2號 |
| 61909911 | 日安藥局３３４８６７ | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮新庄里芬草路二段301號 |
| 45779476 | 泰春中藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮新厝里虎山路699號1樓 |
| 61948549 | 豐坤藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮敦和里10鄰敦和路78之7號 |
| 61756611 | 全盛堂葯局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮敦和里忠孝街220號 |
| 09217233 | 長宏商行 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮敦和里信義街287號 |
| 61953459 | 仁川藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮復興里復興路260號 |
| 61929183 | 華鍵實業股份有限公司 | 廢止 | 非營業中 | 南投縣草屯鎮東山路五之一四號 |
| 23398679 | 惠吉藥品有限公司 | 廢止 | 非營業中 | 南投縣草屯鎮東山路四○之五七號 |
| 61901707 | 楊藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮御史里東山路4之20號 |
| 61941530 | 陸安藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮御史里僑光街26號 |
| 61760827 | 玉燕藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮御史里中正路812之50號 |
| 61767201 | 志豐藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮御史里中正路1701號 |
| 61926398 | 惠仁葯局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮平林里平愛巷2號 |
| 77387419 | 榮美藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮山腳里虎山路49號 |
| 18141848 | 詳富漢藥行 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮富寮里3鄰富昌路11巷11號1樓 |
| 25381701 | 建晟藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里12鄰太平路二段222、224號 |
| 61443301 | 福安西葯房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里碧山路93號 |
| 28094767 | 勝霖藥品股份有限公司草屯碧山分公司 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里碧山路128號1樓 |
| 99915049 | 安佑藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里明賢街2號1樓 |
| 28720183 | 統一生活事業股份有限公司南投縣第一分公司 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里太平路二段238號 |
| 80046355 | 日藥本舖股份有限公司南投草屯門市 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里太平路二段280、282號1樓 |
| 61767743 | 鎮安藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里和興街77號 |
| 61913295 | 廣生堂葯房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮和平里中山街178號 |
| 61778642 | 振興藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮南埔里中正路281號 |
| 61778657 | 健全藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮南埔里中正路269號 |
| 06087411 | 清惠西藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮南埔里中正路257之5號 |
| 06089044 | 大眾藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮北投里1鄰史舘路366號 |
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| 61922533 | 阿中先葯局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮加老里芬草路318之2號 |
| 28756421 | 泰京藥品有限公司 | 廢止 | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中正里中山街252號1樓 |
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| 61048809 | 仁德藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中正里中山街287號 |
| 90684341 | 諾貝兒寶貝股份有限公司草屯分公司 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里14鄰太平路二段179號1樓 |
| 14602377 | 生昇西藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里碧山南路7號 |
| 94920297 | 新丹原藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里明賢街111號 |
| 45528400 | 新丹原藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里明賢街111號 |
| 45309572 | 新丹原藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里明賢街111號 |
| 54603963 | 勝霖藥品股份有限公司草屯中興分公司 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中山里中興路78號 |
| 61757935 | 秀安藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中原里中和路58號 |
| 61790420 | 吉全葯局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮中原里中和路20號 |
| 25382053 | 全方位藥局 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮上林里23鄰太平路一段227號 |
| 61953583 | 惠安藥房 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮上林里草溪路210號 |
| 06095030 | 冠達行 | | 非營業中 | 南投縣草屯鎮上林里太平路一段285巷9弄25號 |
| 61859721 | 順德葯局 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮雲林里雲林路50之1號 |
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| 19248538 | 福倫藥業股份有限公司竹山店 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮竹山里集山路三段860號 |
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| 39785964 | 耀聖藥局 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮竹山里集山路三段816之5號 |
| 87292779 | 耀聖藥局 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮竹山里集山路三段816之5號 |
| 72571112 | 耀聖藥局 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮竹山里集山路三段816之5號 |
| 47352407 | 耀聖藥局 | | 非營業中 | 南投縣竹山鎮竹山里集山路三段816之5號 |
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| 80135472 | 壯業實業有限公司 | 解散 | 非營業中 | 南投縣竹山鎮延和里集山路三段六二三巷一號 |
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| 99914007 | 宜康健保藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮薰化里南昌街261號 |
| 62092704 | 東海葯房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮薰化里中山路三段12號 |
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| 45738855 | 恩典藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮薰化里中山路三段100號 |
| 61804682 | 琳苑藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮薰化里中山路三段76號 |
| 08824885 | 新惠春蔘藥號 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮清新里8鄰南興街277號 |
| 27678243 | 元君國際有限公司 | 解散 | 非營業中 | 南投縣埔里鎮清新里南興街335號2樓 |
| 62224445 | 壽一藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮清新里南興街305號―樓 |
| 38964588 | 躍獅以樂藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮清新里南興街299號1樓 |
| 14615979 | 鎮寶碩士藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮枇杷里33鄰忠孝路311號1樓 |
| 39699222 | 白金藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮枇杷里忠孝路355號1樓 |
| 21404268 | 美立康藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮枇杷里忠孝路355號 |
| 14612656 | 新綸藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮枇杷里忠孝路327號 |
| 06111236 | 救民西藥房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮枇杷里中正路185之5號 |
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| 78105114 | 護生藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮東門里北環路11號 |
| 61842588 | 倉安葯房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮東門里北澤街2號 |
| 24329638 | 統一生活事業股份有限公司南投縣第二分公司 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮東門里中正路393號 |
| 61803537 | 信東西葯房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮東門里中正路293號 |
| 61818829 | 昭仁西藥房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮大湳里中山路一段252號 |
| 62049708 | 吉本藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮大城里3鄰中山路三段233號 |
| 47576764 | 東京藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮大城里信義路1029號 |
| 18141066 | 尚寶企業社 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮大城里中山路三段642之1號 |
| 06122888 | 安安西藥房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮大城里中山路三段315號 |
| 82402333 | 家康藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮同聲里隆生路78號1樓 |
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| 80118842 | 好溫心藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮南門里西安路一段86號1樓 |
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| 25262819 | 全新藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮南門里南昌街196號1樓 |
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| 62152300 | 得安堂藥房 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮南門里中山路二段401號 |
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| 54136519 | 心寬生技實業有限公司 | 廢止 | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北門里北環二巷1弄10號1樓 |
| 28904149 | 美闊生物科技股份有限公司 | 解散 | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北門里中山路二段295號2樓 |
| 21408617 | 進安藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北門里中山路二段269號 |
| 45679482 | 北門大藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北門里中山路二段196號 |
| 45297745 | 昭文藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北門里中山路二段182號 |
| 61801806 | 曰生藥局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北安里中華路280號 |
| 61839107 | 崇安葯局 | | 非營業中 | 南投縣埔里鎮北安里中山路二段77號 |
| 18142311 | 沐一生企業社 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉福龜村3鄰中正路一段320號 |
| 61803327 | 吉安商號 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉福龜村中正路483號 |
| 10944838 | 山芙蓉藥局 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉石門村16鄰中興路146號 |
| 06109581 | 佑全藥局 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉石門村中興路103號1樓 |
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| 61803332 | 永安號 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉北山村南港路193之7號 |
| 61839970 | 龍德葯局 | | 非營業中 | 南投縣國姓鄉北山村中正路168之1號 |
| 61756443 | 國松藥房 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉松柏村名松路二段262號 |
| 87816895 | 三明藥局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉松山村松山街50巷2號 |
| 61755943 | 正宜葯局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉東湖村彰南路305號 |
| 61794586 | 宏春葯房 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉新街村彰南路395之1號 |
| 06081774 | 大庄藥局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉大庄村南田路129號 |
| 06102031 | 廣承藥房 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉南雅村市場巷14號 |
| 61784834 | 聖仁葯局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉南雅村員集路121號 |
| 61908883 | 源興藥局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉南雅村南雅街19號 |
| 19240178 | 淵源藥局 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉中正村5鄰南雅街131巷35號 |
| 18127374 | 豪家家五金大賣場 | | 非營業中 | 南投縣名間鄉中正村彰南路88之13號 |
| 61792222 | 新建美葯房 | | 非營業中 | 南投縣南投市龍泉里民族路240號 |
| 14604558 | 龍安藥局 | | 非營業中 | 南投縣南投市龍泉里民族路202號 |
| 61397003 | 新南光藥房 | | 非營業中 | 南投縣南投市軍功里5鄰軍功路93號 |
| 61755710 | 清鴻藥房 | | 非營業中 | 南投縣南投市軍功里軍功路93號 |
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